Zadání studentských prací

Zadání výzkumného úkolu

Základní údaje

Posluchač:
Program / Obor:

Název (CZ):	Analýza a vyhodnocení biologických dat
Název (EN):	Biological data analysis and evaluation

1.	Proveďte rešerši stávajících metod zpracování obrazové informace a strojového učení se zaměřením na analýzu biologických dat - detekci, segmentaci a sledování buněk.
2.	Nastudujte charakter dodaných obrazových dat z Ústavu biochemie a mikrobiologie VŠCHT a vytvořte z nich datové sady pro trénování algoritmů.
3.	Navrhněte metriky pro automatické vyhodnocování algoritmů na daných datech.
4.	Otestujte vybrané algoritmy a implementujte je do nástrojů použitelných pro výzkumníky z VŠCHT.
5.	Vyhodnoťte úspěšnost navržených řešení pomocí anotovaných dat.
6.
7.
8.

Vyžadovaný formát referencí

Dodržujte následující formátování seznamu použité literatury. Pokud formát nedodržíte, bude Vám zadání vráceno k přepracování.

článek v časopise: Autor/ři, Název_článku. Název_časopisu ročník, rok, stránky.
příklad: K. G. Hare, Tiles in quasicrystals with quartic irrationality. Mathematics of Computation 75, 2009, 405–420.
kniha: Autor/ři, Název_knihy. Vydavatel, rok.
příklad: N. L. Johnson, S. Kotz, N. Balakrishnan, Continuous univariate distributions. John Wiley & Sons, New York, 1994.
příspěvek ve sborníku: Autor/ři, Název_příspěvku. In ‘Název_sborníku’, Vydavatel, rok, stránky.
příklad P. Mueller, P. Wonka, S. Haegler, et al., Procedural modeling of buildings. In ‘ACM SIGGRAPH 2006 Papers’, ACM New York, 2006, 614–623.

1.	R. O. Duda, P. E. Hart, D.G. Stork, Pattern classification. John Wiley & Sons, 2012.
2.	I. Goodfellow, Y. Bengio, A. Courville, Deep learning. MIT press, 2016.
3.	J. Flusser, B. Zitova, T. Suk. Moments and moment invariants in pattern recognition. John Wiley & Sons, 2009
4.	O. Ronnerberger, P. Fischer, T. Brox. U-Net: Convolutional Networks for Biomedical Image Segmentation. MICCAI 2015
5.
6.

Školitel:
	(Celé jméno a příjmení s tituly)
Pracoviště:	Ústav teorie informace a automatizace AV ČR, v.v.i. oddělení Zpracování obrazové informace Pod Vodárenskou věží 4 182 08 Praha 8
	(Název instituce a adresa)
Email:
Telefon:

Konzultant:
	(Celé jméno a příjmení s tituly)
Pracoviště:
	(Název instituce a adresa)

Datum zadání:
Datum odevzdání:

Stav zadání

Schváleno KM

Historie

2023-09-26 11:57:34

– zahájení procesu zadání

2023-10-03 21:02:40

– zasláno školiteli

2023-10-24 13:34:48

– upraveno školitelem

2023-10-24 13:36:31

– zasláno školiteli

2023-10-24 13:43:18

– upraveno školitelem

2023-10-24 13:48:32

– zasláno na KM

2023-10-24 16:37:50

– žádost o autorizaci

2023-10-24 18:34:47

– autorizováno školitelem

2023-10-31 16:53:33

– schváleno KM